Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme6O88425 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nme6O88425 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms