Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnnt1O88346 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tnnt1O88346 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnnt1O88346 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms