Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Srpk1O70551 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srpk1O70551 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms