Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lnx1O70263 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lnx1O70263 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lnx1O70263 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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