Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms