Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dsg2O55111 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dsg2O55111 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms