Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NlkO54949 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NlkO54949 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NlkO54949 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NlkO54949 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NlkO54949 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NlkO54949 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NlkO54949 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NlkO54949 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NlkO54949 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NlkO54949 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms