Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Socs5O54928 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Socs5O54928 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Socs5O54928 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms