Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brs3O54798 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms