Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnnd2O35927 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnnd2O35927 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms