Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lsm2O35900 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lsm2O35900 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms