Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NudcO35685 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NudcO35685 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NudcO35685 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NudcO35685 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NudcO35685 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NudcO35685 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NudcO35685 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NudcO35685 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NudcO35685 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms