Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Efnb3O35393 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Efnb3O35393 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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