Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kpna6O35345 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna6O35345 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms