Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn4O35054 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms