Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casq1O09165 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casq1O09165 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casq1O09165 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Casq1O09165 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms