Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LfngO09010 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LfngO09010 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LfngO09010 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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LfngO09010 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LfngO09010 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LfngO09010 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LfngO09010 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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LfngO09010 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LfngO09010 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms