Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CckarO08786 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CckarO08786 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CckarO08786 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CckarO08786 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CckarO08786 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CckarO08786 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CckarO08786 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckarO08786 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckarO08786 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms