Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Casp6O08738 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Casp6O08738 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Casp6O08738 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Casp6O08738 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casp6O08738 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms