Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8050L7N2E3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8050L7N2E3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms