Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm20878L7N244 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20878L7N244 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20878L7N244 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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