Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp955bL7N232 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms