Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm379J3QQ19 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Gm379J3QQ19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Gm379J3QQ19 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm379J3QQ19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Gm379J3QQ19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm379J3QQ19 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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