Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm8356J3QPD3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm8356J3QPD3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm8356J3QPD3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms