Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm2035J3QP87 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm2035J3QP87 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm2035J3QP87 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm2035J3QP87 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Gm2035J3QP87 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2035J3QP87 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms