Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21818J3KMS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21818J3KMS6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms