Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20815J3KMI0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20815J3KMI0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20815J3KMI0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20815J3KMI0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20815J3KMI0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20815J3KMI0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20815J3KMI0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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