Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nccrp1G3X9C2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nccrp1G3X9C2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms