Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl3l2G3X992 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl3l2G3X992 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms