Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cldn34aG3UW52 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms