Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srp72F8VQC1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms