Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5830473C10RikF8VQ07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms