Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Farp1F8VPU2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Farp1F8VPU2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms