Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm28038F7BCN9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Gm28038F7BCN9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Gm28038F7BCN9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28038F7BCN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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