Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms