Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sptbn5F6UCX4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms