Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm29094F6Q785 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm29094F6Q785 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms