Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc74aE9Q9U8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms