Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms