Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ythdc1E9Q5K9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms