Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ApobE9Q414 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.9 ms