Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Susd1E9Q3H4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms