Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NebE9Q1W3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NebE9Q1W3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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