Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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