Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt78E9Q0F0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt78E9Q0F0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms