Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx60E9PZQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx60E9PZQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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