Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ryr1E9PZQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms