Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5415E9PXF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5415E9PXF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms