Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc144bE9PVZ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms