Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc175E9PVB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc175E9PVB3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms